BADAN

Описание

BADAN (6-бромацетил-2-диметиламинонафталин) — тиол-реактивный флуоресцентный краситель, ковалентно связывающийся с сульфгидрильными группами цистеиновых остатков белков. Относится к классу нафталиновых флуорофоров, чувствительных к полярности локального окружения, что делает их удобным инструментом изучения конформационных изменений белков.

Основные атрибуты

• CAS №: 210832-86-3
• Химическая формула: C14H14BrNO
• Молекулярный вес: 292,17
• Точная масса: 292,17
• Идентификатор DSSTox: DTXSID30376326
• Характеристики PSA: 20,3
• XLogP3: 3,4834

Физико-химические характеристики

• Плотность: 1,416 г/см3
• Температура плавления: 117–120 °C
• Температура кипения: 415,4 °C при 760 мм рт. ст.
• Температура вспышки: 205 °C
• Показатель преломления: 1,66
• Условия хранения: морозильная камера при температуре -20 °C
• Давление пара: 4,13×10⁻⁷ мм рт. ст. при 25 °C (4,13E-07)

Механизм действия и применение

Бромацетильная группа BADAN алкилирует тиоловую группу цистеина белка с образованием стабильной ковалентной связи, а диметиламинонафталиновый флуорофор становится чувствительным зондом локального микроокружения. Интенсивность и спектральное положение флуоресценции BADAN изменяются в зависимости от полярности окружения метки, что позволяет отслеживать конформационные перестройки белка, взаимодействия белок-белок и белок-лиганд в режиме реального времени. Реагент широко применяют в биофизических и биохимических исследованиях фолдинга белков и в разработке флуоресцентных биосенсоров на основе цистеин-специфичного мечения.

Физико-химическая интерпретация

Значение XLogP3 3,4834 указывает на выраженную липофильность молекулы, характерную для ароматических флуорофоров, что облегчает проникновение реагента в гидрофобные участки белковой глобулы. Низкое значение площади полярной поверхности PSA 20,3 Å2 согласуется с преимущественно неполярной нафталиновой структурой соединения.

Хранение и обращение

Данные о классификации опасности, транспортных кодах и GHS-фразах для BADAN в открытых источниках и в исходном дампе отсутствуют. Хранить в морозильной камере при температуре -20 °C, в защищённой от света герметичной таре — краситель светочувствителен и подвержен деградации при комнатной температуре. Рабочие растворы готовят непосредственно перед экспериментом в безводном органическом растворителе (обычно ацетонитриле или диметилформамиде), поскольку бромацетильная группа гидролитически нестабильна в водной среде. При работе использовать перчатки и защитные очки.

Практические аспекты применения

Стехиометрия мечения обычно контролируется небольшим молярным избытком красителя относительно белка при слабощелочном pH, обеспечивающем нуклеофильность тиоловой группы цистеина. После завершения реакции избыток непрореагировавшего красителя удаляют гель-фильтрацией или диализом, чтобы исключить фоновую флуоресценцию несвязанного зонда при последующих измерениях.